Коэффициент седиментации

У вирусных частиц, содержащих одноцепочечную РНК, геном существует в виде одной единственной полинуклеотидной цепи. Лучшим доказательством этого в случае ВТМ послужило совпадение данных о размерах молекул его РНК, рассчитанных на основании известной структуры вирусной частицы и измеренных в экспериментах с изолированной РНК ВТМ. Каспарвычислил, что число нуклеотидов на 0,1 им длины вирусной палочки составляет 2,13. Длина палочкообразных частиц на основании исследований (что наиболее достоверно) была определена равной 298 нм, что соответствует 6340 нуклеотидам на одну вирусную частицу. Средняя молекулярная масса нуклеотидного остатка в РНК с тем же составом оснований, который обнаружен в РНК ВТМ, составляет 322,3.

Гирер использовал физико-химические методы для определения размера РНК, выделенной из ВТМ. При этом необходимо было знать коэффициент седиментации и величину характеристической вязкости вирусной РНК. Измерение характеристической вязкости осложнялось тем, что препараты содержали некоторое количество частично деградированной РНК. Гирер определил экспериментально соотношение между молекулярной массой, коэффициентом седиментации и вязкостью.  Такие эмпирические формулы очень полезны, но следует помнить, что величина коэффициента седиментации зависит от условий эксперимента. В одних и тех же условиях значения коэффициентов седиментации двух РНК одного ж того же размера могут быть различными, если они имеют в растворе различное относительное число участков со вторичной структурой. После обработки различных РНК формальдегидом можно получить истинное соотношение.