Очищенные препараты

Большинство вирусных препаратов почти всегда представляет собой смесь мутантов, даже если родительский штамм в основном преобладает в препарате. Травянистые растения, обычно используемые при работе с вирусами, содержат в целом около 10 клеток мезофилла. Если инфицировано все растение, то в нем имеется около 10 вирусных частиц на клетку. Благодаря этому создаются широкие возможности для возникновения мутантов, которые появляются даже в том случае, когда растение первоначально было заражено одной-единственной вирусной частицей. РНК таких мутантов будут различаться по крайней мере по одному нуклеотиду. Если такая мутация происходит в цистроне, кодирующем белок оболочки, то этот белок в таком случае также будет отличаться от белка родительского штамма.

Очищенные препараты некоторых вирусов могут содержать неполные частицы, которые не обладают инфекционностью.

В настоящее время известно несколько вирусов, существующих в виде многокомпонентных систем, в которых две или более разные частицы взаимодействуют при репликации вируса.

У некоторых крупных вирусов инфекционные частицы могут быть самых разных размеров. При этом трудно ожидать, чтобы инфекционные частицы крупных вирусов, окруженных мембраной, имели бы абсолютно идентичную структуру.