Нарушение спаривания

По-видимому, существует четыре пути, по которым различные агенты могут инактивировать вирусную РНК, находящуюся либо в составе интактного вируса, либо в свободном состоянии: 1) возникновение разрывов в состове РНК, причем одного разрыва в вирусной РНК достаточно для ее необратимой инактивации. К числу факторов, действующих исключительно или в основном таким образом, относятся рентгеновские лучи, нагревание, ультразвук, высушивание, высокие давления, неблагоприятные значения рН, «старение» и нуклеазы; 2) утрата какого-то основания (или оснований) РНК без разрыва фосфодиэфирного остова, например в случае действия при рН 9 на РНК ВТМ; 3) изменение оснований РНК, приводящее к образованию нефункциональных групп, без разрыва фосфодиэфирного остова. Такие изменения in vitro можно вызвать действием различных химических реагентов при соответствующим образом контролируемых условиях, примером чего может служить некоторых оснований под действием азотистой кислоты. In vivo такие изменения можно вызвать введением в растение соответствующего аналога оснований, который включается в вирусную РНК и тем самым делает ее неинфекционной (например, включение 8-азагуанина и 2-тиоурацила в РНК ВТМ); 4) образование комплекса или химическое присоединение к вирусной РНК.

Механизм действия подобного рода приписывали многим веществам, особенно неидентифицированным ингибиторам, присутствующим в клеточных экстрактах. Однако, вероятно, единственным примером, когда связывание, как было установлено, является необходимым этапом инактивации, служит образование комплекса между специфическим антителом и вирусом. Неясно, каким образом антитело инактивирует вирус, но оно может полностью предотвращать РНК в клетке. К этой категории ингибиторов можно также отнести полиэлектролиты, например.

К этой группе относятся аналоги пуринов и пиримидинов, такие, как 8-азагуанин и 2-тиоурацил, однако детали механизма их действия неизвестны. Некоторые возможные механизмы таковы: 1) нарушение спаривания оснований в системе во время синтеза вирусной РНК; 2) образование дефектной вирусной матрицы, приводящее к появлению нефункциональных или лишь частично функциональных белков; 3) включение аналогов в антикодоны или в участки, предназначенные для узнавания ферментов на транспортных РНК, что приводит к возникновению ошибок при трансляции и в конечном итоге к появлению дефектных белков; 4) недостаточное снабжение предшественниками, необходимыми для синтеза РНК, в результате нарушения функций ферментов, участвующих в синтезе нуклеотидов.